Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm340F6RGI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm340F6RGI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm340F6RGI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms