Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf165E9QAU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Rnf165E9QAU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Rnf165E9QAU8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf165E9QAU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf165E9QAU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Rnf165E9QAU8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf165E9QAU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Rnf165E9QAU8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Rnf165E9QAU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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