Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2bE9QAN8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2bE9QAN8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms