Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q5

1700113H08Rik, RIKEN cDNA 1700113H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700113H08RikE9Q9Q5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1700113H08RikE9Q9Q5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1700113H08RikE9Q9Q5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms