Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrdnE9Q9K5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrdnE9Q9K5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TrdnE9Q9K5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms