Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

Predictions only

Length 2,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Setd2E9Q5F9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Setd2E9Q5F9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Setd2E9Q5F9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms