Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pi4kaE9Q3L2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pi4kaE9Q3L2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pi4kaE9Q3L2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms