Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
Abcc4E9Q236 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Abcc4E9Q236 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Abcc4E9Q236 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Abcc4E9Q236 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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