Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
NebE9Q1W3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms