Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd2E9Q1M1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd2E9Q1M1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd2E9Q1M1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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