Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Zfp558E9Q1J0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Zfp558E9Q1J0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Zfp558E9Q1J0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zfp558E9Q1J0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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