Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt78E9Q0F0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt78E9Q0F0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt78E9Q0F0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms