Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E430018J23RikE9PZQ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E430018J23RikE9PZQ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms