Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Scaf11E9PZM7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Scaf11E9PZM7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scaf11E9PZM7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scaf11E9PZM7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms