Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brd1E9PZ26 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brd1E9PZ26 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Brd1E9PZ26 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms