Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rsf1E9PWW9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rsf1E9PWW9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Rsf1E9PWW9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rsf1E9PWW9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms