Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim5E9PV98 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim5E9PV98 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim5E9PV98 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms