Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FgaE9PV24 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FgaE9PV24 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FgaE9PV24 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms