Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syde2E9PUP1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syde2E9PUP1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Syde2E9PUP1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Syde2E9PUP1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms