Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
5430403G16RikD3Z5L4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
5430403G16RikD3Z5L4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms