Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm4871D3Z0W7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4871D3Z0W7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms