Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc6D3YZP9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc6D3YZP9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc6D3YZP9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc6D3YZP9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms