Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim30cD3YVI9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim30cD3YVI9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim30cD3YVI9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms