Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mterf1bB9EJ57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mterf1bB9EJ57 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms