Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A930018M24RikB7ZMY3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A930018M24RikB7ZMY3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A930018M24RikB7ZMY3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms