Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Abcb5B5X0E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcb5B5X0E4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms