Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syce3B5KM66 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Syce3B5KM66 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syce3B5KM66 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms