Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pnldc1B2RXZ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pnldc1B2RXZ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms