Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Siah3B2RWG3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Siah3B2RWG3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms