Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clrn2B2RVW2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clrn2B2RVW2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clrn2B2RVW2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms