Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan5bB2RTN3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zscan5bB2RTN3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zscan5bB2RTN3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms