Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc22a28B2RT89 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc22a28B2RT89 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms