Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H60cB1B213 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H60cB1B213 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H60cB1B213 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H60cB1B213 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms