Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trabd2bB1ATG9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trabd2bB1ATG9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trabd2bB1ATG9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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