Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700084M14RikB1AT01 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700084M14RikB1AT01 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms