Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm438B1ASB3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm438B1ASB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms