Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp36B1AQJ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp36B1AQJ2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp36B1AQJ2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms