Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cfap221A9Q751 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap221A9Q751 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms