Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint3A7TZF0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint3A7TZF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint3A7TZF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint3A7TZF0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint3A7TZF0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Skint3A7TZF0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Skint3A7TZF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms