Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ttc38A3KMP2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc38A3KMP2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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