Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Odf2A3KGV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Odf2A3KGV1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms