Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ism1A2ATD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ism1A2ATD1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ism1A2ATD1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms