Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn1aA2APX8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Scn1aA2APX8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms