Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhox3fA2ANE1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rhox3fA2ANE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms