Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Frmpd1A2AKB4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Frmpd1A2AKB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Frmpd1A2AKB4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Frmpd1A2AKB4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms