Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prdm12A2AJ77 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prdm12A2AJ77 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prdm12A2AJ77 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms