Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin3aA2AIR5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin3aA2AIR5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin3aA2AIR5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms