Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ambra1A2AH22 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ambra1A2AH22 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms