Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm11A2AGX3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prdm11A2AGX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Prdm11A2AGX3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms