Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn34dA2AGU5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn34dA2AGU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms